Le Père Mindaugas Malinauskas sj est entré dans la Compagnie de Jésus en 2002. De 2002 à 2004, il suit le noviciat à Šiauliai, et en 2004 il prononce ses premiers vœux. Il part ensuite à Innsbruck (Autriche) étudier la théologie, ayant déjà terminé ses études de philosophie au séminaire. Après avoir obtenu son master en théologie, il est ordonné diacre en 2007 et commence à travailler comme aumônier au Gymnase jésuite de Kaunas. Il a été ordonné prêtre en 2008. De 2015 à 2017, il étudie à Rome et otient une licencie en spiritualité ignatienne, puis se lance dans un doctorat.
De mars à juillet 2021, il a effectué son troisième cycle à Naples. Actuellement, il travaille à l'église Saint-Ignace-de-Loyola de Šiauliai et est assistant ecclésiastique de l'église de la Communauté de vie chrétienne en Lituanie. En 2023, il prononce ses derniers vœux à Kaunas. A partir de 2023, il est coordinateur du réseau mondial de prière du pape en Lituanie.