Le Père Mindaugas Malinauskas sj est entré dans la Compagnie de Jésus en 2002. De 2002 à 2004, il suit le noviciat à Šiauliai, et en 2004 il prononce ses premiers vœux. Il part ensuite à Innsbruck (Autriche) pour des études de théologie, car il a déjà terminé ses études de philosophie au séminaire. Après avoir obtenu son master en théologie, il a été ordonné diacre en 2007 et a commencé à travailler comme aumônier au Gymnase jésuite de Kaunas. Il a été ordonné prêtre en 2008. De 2015 à 2017, il étudie à Rome en tant que licencié en spiritualité ignatienne, et à partir de 2017 en tant que doctorant.
Durant l'été 2014-2021, il suit le programme terciato à Naples. Actuellement, il travaille à Saint-Jean-de-Dieu à Šiauliai et dans l'église d'Ignatius Loyola à Šiauliai. Il est aussi assistant aiprès de d'église de la Communauté de vie chrétienne de Lituanie.